之后是一个涉及到几何旋转的谜题，其中一个样本在容器最里面，（利用念力）转动左边的按钮，则最左的圆环旋转90°，中间圆环旋转60°，转动右边的旋钮，则最右边的圆环转动30°，中间旋转90°。要将所有的角度都调节至90°，就可以利用传送带将样本传出来。
第三个样本继续沿着指引路线（【RS】键，PC版则为B键），来到第二个气体控制室，但是没有电源，先到控制室外边，将电源表面的覆盖板拆下来，再旋转旋钮为控制室提供电源，就能打开另外一条通路了。
最后一个样本在另外一个实验室，出去的时候会遇到人类士兵，改造枪械可以适当把狙击镜给装上，这一战还好，到后面需要狙击的时候难度会很高。另外一个生物实验室需要有红外线陷阱，拉动陷阱中间的巨石挡住射出射线的一方，一个个红外线躲过去即可（取得样本后先不用离开，会有怪物进来，用红外线可以全部秒杀）
之后就是返回实验室和Ellie回合，但是之前，先完成几个支线任务吧。
支线任务1: Repair Barrack
取得第二个样本，前往巴拉克。谜题不多，战斗难度也不高。
支线任务2：Investigate the Supply Depot
在取得三个样品后，乘坐地铁（就在返回的路上可以看到枪械改装系统，更衣道具的房间里）首先前往Supply Depot，触发剧情后一路都有标记指引。电梯旁边按下开关后开启战斗，最后一战难度略高，推荐使用火焰枪+酸性伤害的弹夹，右手武器最好配备自带【静滞】的高攻穿甲武器。可以对付成群的哥布林的时候（首先是哥布林怪物，然后是雪山爪怪和会右手为自爆炸药的怪物，最后才是最恶心的工程兵僵尸，工程兵僵尸对火焰和酸性的抗性很强。节省弹药，可以先将自爆怪物打死，然后用它留下的炸弹对付工程兵僵尸）
支线任务3:Armory
完成第一个任务后乘坐地铁来到前往Armory，最后Danik的手下会带着奖励箱到地铁站等主角。任务并无困难谜题，用前往Supply Depot的装备都可简单完成。
支线任务4：
回到生物研究所，就在地铁站的房间可以找到入口。战斗难度很高，里面的所有怪物都是工程兵，虽然工程兵不会变触手，但是本身高韧性不容易击退，也没有弱点部位，武器攻击属性最好附加电流或者直接带【静滞】效果。最后有一个调节角度的电流通路，然后取得宝箱，恶战之后离开即可。
完成支线任务后返回实验室，漫长的14章终于结束。
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