在邪恶教主和他的病毒槽毁灭后，曾经拯救世界的辐射一代中的英雄受到13号避难所的首脑所排挤，流落至一个原始部落阿罗由，和当地的土著一同开垦这块仍然充斥着辐射尘埃的荒地。经过了80年左右，罕见的干旱降临，牲畜暴毙，儿童因缺乏食物而饥贫交迫。这时，在这个原始部落出生的你，成为村庄的获选者，出外寻找传说中的伊甸园创造器(简称GECK)，由此负起了拯救族人的任务。成为获选者的你，在离开土生土长的阿罗由村庄前，必须徒手接受神殿的考验，然后独自投入外面辽阔的未知世界。在荒野中经历种种磨难后，终于了解到隐藏幕后的黑手竟然是战后的美国联邦政府，他们掌握了战前的尖端科技(如飞鸟直升机、超级护甲)，却勾结奴隶贩子、赌场等黑社会组织，无恶不作，还掳走你村庄中的无辜人民进行人体实验。所以你的最终任务就是摧毁这个邪恶的组织，使得主角的任务由拯救族人的行动进一步升华为拯救世界，成为像你的祖先一样伟大的英雄。
在浩劫后的荒地上，种族歧视仍然存在，但比起辐射一代却有了很大改善，例如破碎丘就是由超级变种人和人类共同开创的矿区小镇，以及你组建的战斗小队成员可以是全身溃烂的僵尸医生、超级变种人警长或者是会说话的可怕变种生物死亡爪。游戏的二代继续沿用一代的引擎，所以人物、物品、战斗系统和前一代大同小异，只有队员的控制方式和车子这两个地方的差异较大。二代提供了较为完善的队员控制方法：队员挡在门口时可以推他离开、可以帮队员换护甲(但为了容易识别，各个队员仍然只有一种图像)、可调整队员的战斗控制设置。
二代的世界地图比一代的大了一倍，所以快速的交通工具汽车的出现也是必然的，让玩家在荒野中尽情奔驰。但可以驾驭的车就只有一部，使用微型核融电池或小能源电池补充动力，宽阔的后车厢可存放大量的物资以以减轻玩家的负重，还能通过一些高级技师对车子进行改善，主要是改进车的能量消耗和后车厢的容量。不过取得这辆车子需要的工夫也不少，不仅要找到车，还必须找到这辆车需要加装的重要零件，才能一享驾驶的乐趣。
二代的剧情比一代更为丰富，包括色情(色情的情节仍然采取画面一黑的方式带过，令人会心一笑)、暴力和灵异。这些古怪的情节包括：急着嫁儿嫁女的屠夫会拿枪押着你的男性角色和他儿子结婚、比腕力输了之后被超级变种人虐待、在新里诺拍色情影片而成为名星;暴力的部份中有两场拳击赛，玩家可向高级拳击手挑战，但必须一路过关斩将，才能获得拳王的宝座;灵异的部份有一个死不瞑目的女鬼，仍然滞留人间寻找她失落的首饰，主角不但可以助她升天，还可拿铲子将她妥善安葬。
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