离开眺望台回到时钟塔2F走廊(30A)时，想不到追击者已回复了战斗力追至，JILL全力逃跑回到1F，总算能逃回时钟塔书房(307)，利用组合出来的“时之神的钥匙”，JILL打开了通往时钟塔走廊(308)的门。躲过时钟塔走廊内的数只大蜘蛛，来到时钟塔储物室(309)。在大门旁边的角落有一名UBCS军人及一名小女孩的尸体，从这名军人身上调查得到文件“佣兵之笔记”。虽然有一个可通往外边的后门，但门前却被一个大钟民塞着，JILL的体力不足以推开它……这房间内最重要的机关，是三幅时之女神的时钟画及三个女神象，这里的破解方法，其实已在文件“美术品的明信片”中暗示了出来，各位要令中央“现在之女神”的时钟画和其余两幅一样变成12时，这样时钟的暗格便会打开，露出藏在背后的“金色齿轮”。 【若“现在”的时钟画最初所指的是9：00，那么便要将“黑曜石”放在“过去”的时钟、“琥珀”放在“现在”的时钟、而“水晶”放在“未来”的时钟】
取得“金色齿轮”后，可再度回到3F的时钟塔机械室(30C)，将两个齿轮组合起来，成功组成了一个“时之神的齿轮”。利用这个齿轮，JILL成功开动了时钟塔响钟的部分。时钟塔的钟声响起，亦即代表UBCS的作战结束，JILL于是利用异次元箱整理好手上的道具离开，在这里笔者强烈建议大家记录一下。
当JILL回到时钟塔庭园时，一部大型的军用直长机出现了……恶梦真的可以终结吗？
正当直升机开始减慢速度准备降落在庭园内，却想不到突然有人以飞弹发射器瞄准了直升机，射出的飞弹毫不留情地将直升机炸个粉碎，这人正是追击者！
追击者从塔顶跳了下来，JILL更不小心被他的触手刺中，伤势严重。
这时候Carlos赶至，他见JILL受到追击者的袭击，便奋不顾身地拿着步枪向追击者攻击，然而追击者以手上的飞弹还击，Carlos被炸得倒在地上，但他仍疯狂地开枪，结果击中了追击者手上的飞弹发射器，爆炸力令追击者倒在地上，Carlos亦因为受伤太重而晕倒过去，但追击者这时已回复战斗力再度展开攻击，JILL只好以受伤的状态来迎战。此战避无可避，大家一定要熟练掌握“紧急回避”并准备回复药品。吃了JILL的无数重击后，强如追击者亦终于支持不住，一步一步的步向火堆后倒下……
JILL也不支倒地。过了一会，Carlos终于回复了意识，虽然他身受重伤，但他似乎更关心JILL的伤势。 Carlos抱着倒在地上的JILL，希望她能尽快清醒过来。
外边响起了阵阵雨声，我到底是否仍然生存呢……
JILL从昏迷中清醒过来，发觉自己正身处时钟塔内礼拜堂的祭坛上，而Carlos就在身旁照顾着她。由于JILL身受重伤，所以接下来的一段故事将会暂时以Carlos为主角。经过一番周折来到时钟塔储物室(309)，成功推开了里间的大钟，Carlos也因此可以从后门来到公园路(400)，进入左方的医院后首先会来到医院大堂(402)，这里遍布了病人和医务人员的尸体，干掉“猎杀者B”后在角落里找到两株“红药草”。经大堂来到医院办公室(403)，这里是有异次元箱及SAVE打字机的房间，打字机旁放了色带，而房间内的柜子上则可取得急救喷剂一支。
经医院办公室可来到医生休息室(404)，这里除了可在医生尸体旁的地面拾得文件“医院长的手记”外，桌子上亦放着一部“卡式录音机”，而房间角落的储物柜内也有一份手枪子弹，从旁边的告示板上可取得“医院的地图”，门边的柜子则有蓝药草。在医生休息室内，有一部可通往医院各层的职员专用升降机，先按下声纹辨认装置的掣，然后便播出录音机的声线，门锁打开了。登上4F，Carlos发现了一名UBCS的队员中枪倒在地上，很明显开枪的人就是Nicholai！Nicholai突然用枪指向Carlos，但这时倒在地上的UBCS队员，以最后的力气取出了一枚手榴弹，两人于是第一时间逃走，Carlos一下侧滚翻闪往房间的另一边，而Nicholai则跳窗跳走（这里好象是四楼……-_-!）。
在资料室的另一边，有一个以小瓶子放满实验标本的房间，在这的桌子上，除了可得到一条“病房的钥匙”外，亦同时可取得文件“照片D”。
离开资料室后，接着可先来到医院401号房(407)，调查门边医生的尸体的话会得到一张写有某个三位数字的纸，各位必须记下这数字，此外亦要留意房间内的摆设，记下在哪一个角落放了一台有多个抽屉的铁架，然后便可到旁边的医院402号房(406)，利用“病房之钥匙”可将房门打开。 医院402号房的构造和401号房差不多，但床的位置则可算是刚好相反，这时各位先要做的，是将那台有多个抽屉的铁架推至和邻房相对的位置，例如若在401号房是进门后的右上角，在402号房便是进门后的左上角；若然在401号房是进门后的左下角，那么在402号房便是进门后的右下角。
当推动铁架至正确的位置后，墙上的壁画便会掉下，露出一个小型冷冻保险箱，而401号房所取得的三位数字，便是用来打开这保险箱的密码，开启保险箱后，可取得放在里面的“疫苗素剂”，这样，在4F的工作便全部完成，可回去以升降机前往B3了。
到达B3，沿着医院B3走廊(409)会来到医院实验室(40A)，如无意外这里应该会有两只猎杀者，不过这房间并没有什么特别重要的道具，各位可直接前往共邻接的医院研究室(40B)，在这大型培养槽，里面所装的竟然是一种类似猎杀者的怪物，它们其实是另一种型号的新型猎杀者“HUNTERγ”，不过这时它们被培养槽封着。进入房间后，首先可到柜子取得“培养液基座”，而在房间的尽头，设置了一台药品的合成装置，其背后的桌子上则放了指导如何使用这装置的文件“医疗机器使用手册”，看过手册后，知道要先按动在装置旁边的电力供应切换机，将电力转到合成装置才可，接着是将“培养液基座”安置在合成装置上，当适当地设定合成装置各手掣的开关（Ⅰ、Ⅲ、A），将两边的指数调整至中央时，装置便会成功制造出一支“疫苗培养液”，之后只要将它和“疫苗素剂”混合，便能制作出一支对病毒感染有效的“疫苗”。
然而，当Carlos正打算拿疫苗回去救JILL的时候，培养槽内的两只“HUNTER γ”却突然苏醒过来，将培养槽撞破冲出来向你袭击，而且更是以前后夹攻的方法将Carlos包围，为免浪费子弹及冒险，各位可尝试在“HUNTERγ”出现的EVENT片段结束后马上逃回医院实验室(40A)，接着是回到409“医院B3走廊”，这里有可能会出现两只“HUNTER β”，若听到有敌人的声音则应马上瞄准通道墙上的炸药将它引爆，这样是可以击倒其中一只的。之后可利用升降机回到1F，当回到医院大堂(402)时，Carlos突然发现眼前的柱子被人安装了一个计时炸弹，而且距离爆炸就只剩下6秒多的时间，Carlos于是第一时间从医院的正门逃走，最后总算赶得及逃离爆炸范围，医院则灰飞烟灭……
抹过一把冷汗后，Carlos开始沿时钟塔的后门回到时钟塔储物室(309)，这时他感到天花有点震动，但就没有什么东西出现，反而是储物室本身出现了女丧尸或SLIDING WORM，然而当他回到时钟塔大堂(304)时，天花上的震动再度出现，追击者撞破天花跳进来！不过Carlos亦不一定需要和他硬拼，只要在他再现的EVENT片段结束后马上180度转身冲前开门便可逃过。追击者不会在食堂(302)出现，却会在Carlos进入跳舞厅(301)的时候冲进来，但只要你一直跑向时钟塔礼拜堂(300)的话，他是刚好赶不及追上来的。
回到礼拜堂后，Carlos马上跑到祭坛前，将疫苗注射到JILL的身上，药到病除，JILL亦清醒过来。
两人突然听到房外传来了追击者的吼叫声！
接着Carlos便会一个人离开礼拜堂，游戏亦会回复到操作JILL来进行的状态。装备好武器，从异次元箱取得“开锁铁线”后，JILL便可沿刚才Carlos所走的路前往时钟塔储物室(309)，但要留意追击者会在JILL来到跳舞厅(301)的时候破门而出，若各位选择逃走的话，他便会一直追JILL直至到达时钟塔储物室(309)，但只要专心逃走，是可以有足够时间闪避的。
阿凡达潘多拉边境
博德之门3
心灵杀手2
星空
