首先故事描述了这个行星的背景以及AKRID与人类的情况，几十年下来情况一直没有好转，但是却在那发现了新的能源。随后镜头一转，一小支部队从雪地里慢慢进入了一个建筑，部队在建筑物内分为两组小心的搜索着什么，突然一个会翻滚攻击的Akrid-Dongo突然发动了袭击，所幸损失不大，大家马上进攻了它的弱点T-ENG的地方将其消灭，接着更多的Dongo出现，主角Wayne的父亲驾驶VS将其消灭，另外一面Wayne也大发神威将另一面的Dongo全部清空，正当Wayne有更大的动作时候，他的父亲警告他不要太充英雄，Wayne只得无奈的摇摇头，驾驶VS跟随部队继续深入……
Wayne醒来后，发现自己躺在了一张床上，自己的手臂上接着一跟装置，T-ENG正在不断的往里面输入进去，正当他纳闷的时候，一个白发男子走到自己面前，自我介绍道自己叫Yuri，并且告诉Wayne现在他的手臂被改造过，只要不是被一击毙命，T-ENG就会快速的恢复他的生命力，并且希望Wayne能够为这件事情保守秘密（当时正在记东西，不是看的很清楚，这段剧情）。这个时候门外进来一个貌美的女子和一个头发弄的跟拖把一样的青年，刚进门后，男子就迫不及待的介绍起了自己，他叫Rick，旁边的女子不紧不慢的告诉他自己叫Luka，介绍完毕后，大家关切的问起Wayne怎么会受了这么重的伤，发生了什么事。Wayne刚开始回忆就发觉自己的头开始疼了起来，依稀记得Green Eye众人见他说起Green Eye十分吃惊，然后越来越严重的头疼让主角只能记得Green Eye杀死了自己的父亲，便再也回忆不起任何东西，众人见他这么痛苦，便不再勉强，关切的看着Wayne。当Wayne好转后众人围聚在会议室，研究如何扫清新近发现的一个Akrid的巢穴，但是无人会驾驶VS，这时Wayne站出来说自己会，大家十分的惊喜，正当高兴的讨论的时候，Wayne却非常急切的要求Yuri动作快一点，口气非常冲，众人知他刚失去父亲，心情不好也没加责怪。
肃清Akrid的巢穴后，Yuri将Wayne召了回来，并且在会议室里将四人集合起来，告诉Wayne他们自己发现了雪贼的基地，Luka和Rick对此十分的吃惊，但是Wayne却对此没有什么表示，因为他不是很清楚雪贼这个称号的意义，于是众人将雪贼的来历和背景详细的解释了一遍，Wayne并没有退缩更加坚定的表示自己会去将这个基地端掉，因为现在能记起来的也只有战斗而已。
Wayne回到基地后拿出在雪贼基地拿到的PDA，Rick上前一把抢过很兴奋的说，如果能把它破解将会拿到许多有用的信息，这个时候Yuri看见了PDA后面AEVEC的字样露出了非常耐人寻味的表情，在一边的Luka发现了他的表情后奇怪的问起他是不是知道什么，Yuri立即掩饰说自己没什么，这个时候Wayne突然再次因为头疼晕了过去，众人的注意力立即被吸引了过去，这件事情才算过一个段落。梦中Wayne梦到了自己的父亲，他关切的询问着Wayne的情况以及告诉Wayne关于手的某些东西。起来后来到了会议室门前，听到了里面的争吵声，Luka大声质问Yuri那台Thermal Energy的装置的去向，在Yuri说出交给了Wayne后，Luck公开的表示了自己的怀疑，说自己凭什么去相信这么一个素不相识的人，然后夺门而出，刚好看见站在门口的Wayne，气氛显得非常的尴尬，Luck站在门口和Wayne对视一阵后没有讲什么，拂袖而去。Wayne进去后装作很不在意的样子，询问PDA有否破解，因为他希望战斗能让自己忘记身边的不快，现在的自己也唯有不停的战斗似乎才能体现自己的价值。
Wayne回到基地后，发现NEVEC的人在和Yuri对话，非常的吃惊，就在门口等待并且听听他们在讲什么。NEVEC的两名士兵说Yuri答应了他们的要求，有了他的帮助，Frontia计划一定会更加完美迅速的完成，Yuri一阵客气后让他们问候他们的首领。等NEVEC的人出去后，Wayne快步进入会议室非常吃惊的质问到Yuri怎么会为NEVEC工作，Yuri却轻松的说到他和NEVEC合作是有原因的，因为他想让这个星球变的温暖能够适合人居住，有了这些能源后一定会成为一个富饶的星球，Wayne却一下就点破了他，先不说这个环境遍地的Akrid的存在，怎么可能达到这个要求，Yuri不紧不慢的告诉Wayne正因为这个原因他才和NEVEC合作，他们和他有共同的愿望，有了他们的帮助，这个计划才能得到实现，并且自认为Luck和Rick会支持他的想法。之后为了防止Wayne继续质问下去，立即告诉Wayne明天还有繁重的任务等着他，让他早点去休息一下，明天将会是忙碌的一天。
当Wayne回去后，Luka冲到他面前焦急的说到Yuri找不到了，马上Rick也匆忙的跑了过来确认的确是找不到了Yuri四处都不见他的人影。Wayne联系起前几天的情形，立即想到了是怎么回事，Luka马上看出了Wayne的不对劲，立即上前询问道是不是他知道什么，Wayne摇了摇头没有说出原因，Rick六神无主的说现在怎么办，Luka见Wayne不愿意说，也没说什么，当机立断的说明现在的行动保持不变，明天Wayne还是向第2条山道前进。
回到基地门口，三个人聚在一起，Luka告诉Wayne已经找到了Green Eye的行踪，然后对自己以前对Wayne的不信任做出道歉，感谢他能在这种时候还留下来，如果这个时候他选择离开也是正常的Wayne非常温柔的说没有什么（肯定是难得在这个狗不拉屎的地方找到个御姐不容易，赶他都不见得会走），这个时候Rick也上前表达了自己的谢意。正当大家温馨的时候，女飞贼Basil驾着自己的VS来到了自己的面前，Wayne正在高度戒备的时候，Basil说自己这次不是来找麻烦的，于是Wayne就要求她下来见个面，并留下名字。Basil下来后告诉Wayne他们自己是来找Solotor的，Luka告诉ayne，Yuri的名字的后半部分就是这个，Wayne告诉Basil说Yuri早就不在这个地方了，Basil不相信他的话，坚持要他们交出Yuri并且拔出枪来，告诉他们Yuri利用完他的家族后，全部把他们杀死了，所以她要报这个仇，情况一触即发，在Wayne的坚持下，Basil终于相信，说Yuri肯定是回NEVEC去了，因为他本来就是他们的一分子，说完后询问了Wayne姓名坐上VS离开了。Luka走上前似乎想说什么，Wayne说道我们是为了Green Eye而来先把这个事情做个了断吧。
Green Eye死后Luka马上驾驶着摩托来到了Wayne的身边，关切的询问着情况，这个时候几个NEVEC的士兵出现在了他们的头顶，开枪攻击，Wayne马上驾驶VS挡住了攻击，开枪解决了这些士兵，这个时候，角落里一架类似蜘蛛形态的VS发出了偷袭，Wayne发现后马上一边闪避，一边尽力击落攻来的导弹，但是还是功亏一篑，被最后的导弹击中，VS瘫了下来。NEVEC的士兵们马上围了上来偷袭的VS也出现在Wayne面前，打开仓门后原来是NEVEC的指挥邦帝罗，他示威般的展示着自己手臂的特殊，Luka吃惊的发现他的手臂和Wayne的一模一样。这个时候Wayne的脑海中浮现出他父亲的记忆，邦帝罗用尽手段得到了这个手臂并且告诉Wayne的父亲自己不惜一切代价都会完成Frontia计划，之后命令士兵枪杀了他，Wayne的父亲死前嘱咐Wayne一定要不惜代价的阻止Frontia的计划醒来后的Wayne极其愤怒，开始暴走，重新启动了VS上前要和邦帝罗拼命。在对攻中，邦帝罗突然发现了在一边的Luka，马上回头攻击，Luka虽然马上进行逃避，被打下了车来，Wayne看见这个情况分了心，被邦帝罗击中，VS完全瘫痪了，Luka也被NEVEC的士兵包围了起来，正在这个危机时刻，Wayne冲出了仓门，开是摩托将Luka救走。但是来到基地后，发现基地已经被人攻击，成为了一堆废铁，Rick也失踪不见，正当Luka焦急的上前寻找Rick的时候，Wayne的手臂起了反映，也逐渐失去知觉混倒在了雪地上……
一年后，两人还是没有找到Rick，只能强忍悲痛，尽力阻止NEVEC的Frontia计划。这天Luka在雪原上发现了行军的NEVEC的军队，猜测他们应该去攻打学贼的要塞，Luka让Wayne无论如何都要阻止他们，Wayne答应后披挂上阵。
Wayne进入室内，发现一个NEVEC的士兵正在对着电脑输入着什么，便拔枪上前，这时那个士兵也发现了Wayne，两人同时用枪指着对方进行着对峙。Wayne让他打开头盔并询问他在干什么，士兵笑到这样一对一大家都是等同的机会。这个时候Basil进来，拿着枪对着士兵说那如果是二对一呢，士兵没有办法只能丢下手枪，乖乖说出自己正在输入有关Frontia Project的内容，Wayne听到这个突然迟疑了一下，那个士兵马上抓住了空挡，强行扭转Wayne手上的枪向Basil射去，Basil举起手臂挡了下来和Wayne两人制服了该士兵，这个时候一个PDA从士兵身上掉了出来，Wayne询问Basil是否没事，Basil举起和Wayne一样的手臂示意自己没什么大碍，并说将这个PDA带回去给Rick破解，可以了解许多东西。
两人将士兵押回基地后，囚禁起来。Rick这个时候破解了PDA，里面写着Frontia Project的详细内容，并且与之相关的一个叫做Volcano Demo是该计划的至关重要的环节，并且里面还提到了Vuri。Wayne决定尽快出发，破坏这个Demo。
解决完VS后，一个戴着眼镜的男子凭空出现在Wayne的面前，这个时候Luka提醒Wayne他附近却并没有生命的迹象。这个男子首先假惺惺的赞扬了Wayne过人的身手，然后开始吹嘘自己的Frontia Project计划是多么的完美，能将这个星球从现在恶劣的环境中解救出来，拼命的在那哓以事理，希望能打动Wayne加入。但是Wayne却一句话打破了他的梦想，Wayne质问他为什么杀了自己的父亲，那男子询问后才得知原来Wayne是Gale的儿子，说Gale不能理解他们的做法自然要消灭，想不到小子和老子一个脑筋，听到这Wayne已经按捺不住，气愤的开枪连射，这个时候影象退去，出现了一个损坏的影象球。
Wayne回到基地后，抓回来的NEVEC士兵Joe询问接下来该怎么办，Wayne无以回答，Joe质疑这样下去不是前功尽弃了么，Luka终忍耐不住，拍案怒道我们也想有所作为，但是目前的情况我们根本作不了什么。Joe来到电脑前，拿出记忆卡，放入电脑，这个时候桌子上显示出了之前穿越的峡谷的地图，众人很奇怪这个不是之前去过的峡谷么，Joe却说在峡谷下面还有一片废墟，NEVEC在下面拥有一个很大的Thermal Energy站，里面的T-ENG足够NEVEC用上数年，如果他推测不错的话，里面一定是NEVEC部署Frontia Project计划的地点，众人大喜，立即出发前往。
解决完巨型的Akrid后，邦帝罗出现在Wayne的面前，嘲讽般的称赞道想不到你的身手居然不错但是和我对抗你还远不够资格，说话间突然拔出枪来射向Wayne的腿上，这时身后的蜘蛛型VS也围了上来，正要击毙Wayne。突然两炮袭来将两台VS瞬间轰杀，另外台VS和邦帝罗也因为突发的情况看往攻击袭来的上方，原来是Joe开的枪，Joe来到了Wayne的面前举枪和邦帝罗对峙着，邦帝罗却对眼中的叛徒丝毫也没有在意，告诉Joe为了Frontia Project计划，他们不惜消灭一切阻碍，所以他们在他的眼中只是微不足道的尘埃，就在邦帝罗的滔滔不绝中，Wayne的情况越来越恶劣，邦帝罗却故意问他怎么了，怎么不好好听他在讲什么，眼看Wayne就要失血过多的时候，Rick来到原先Joe的枪前，好不容易架起枪开枪击破了最后架VS，并把邦帝罗逼跑了，Joe马上扶着Wayne逃离了现场。
Wayne终于从昏迷中醒了过来，看见Luka就在眼前照顾着自己，Wayne告诉Luka说自己有预感自己的记忆将开始恢复，Luka却毫不在意的说无论如何她都会相信他，Wayne却没趣的说他连自己都信不过自己，Luka也不在意。这时另外一场景，Joe正向Rick道歉，说自己突然离开并不是因为其他的原因，而是好奇NEVEC到底在做什么，Rick虽然很生气，但是还是原谅了他，并说至少他救了Wayne，而且每个人的处境不同。Joe突然闯进了Wayne休息的房间，Luka显然对Joe有所戒心，并且对Joe这么冲入房间感到不满，Wayne劝走了Luka后，Joe说自己想通了，以前一直以为这个Frontia Project计划只是为了整座星球，想不到他们是为了自己能够独占所有的资源，他现在下定决心带领众人去阻止这个计划不再有所保留，Wayne说自己能相信他，Joe很吃惊Wayne不生自己气Wayne则表示每个人的行为都有自己的苦衷，但是他能相信Joe能够分清利弊，两人将手握在了一起…………
打垮绑帝罗驾驶的VS后，Wayne看着邦帝罗从VS下来，头盔里已经全是血，早已看不清面孔，冷然地面对着他的枪，又目视着他倒下，然后走向VS。这个时候Luka再次催促Wayne尽快赶过去同时Basil驾驶着摩托也赶到了Wayne的面前，询问Wayne有没有找到Yuri，Wayne回答她说已经找到了正要赶去，让basil一起过去吧并让她不要再记恨过去的事了，那只是个误会。而basil却说她已经想明白了，已经不怪Yuri了，毕竟他父亲的所为不能让他来承担，但是现在她却不能走，因为她必须留下来为Wayne争取更多的时间。Wayne没有办法只得坐上VS赶去，在Wayne赶路的时候Basil一边布置炸弹，一边和Wayne说如果他用上Yuri给他的晶片后很有可能记忆会再次丧失，但是他父亲的VS却会得到进化，Wayne说他不在乎，早已做好准备，只要能阻止Frontia Project他绝不会在意这点牺牲。这个时候Yuri已经开始支持不住开始向Luka询问Wayne有没有来，Luka告诉他Wayne正在赶来让他再多休息会，可是Yuri仍然不放心，问Rick有没有看到Wayne拿到晶片，Rick拿出之前在分开前Wayne交给他的晶片。这个时候，NEVEC的部队已经赶到刚才Wayne和邦帝罗决斗的场所，而Basil为了Wayne能赶到Yuri那，开始与他们展开拼斗，Wayne立即在无线电里听到异常，忙询问Basil发生了什么，Basil终于寡不敌众被乱枪击中却仍然摇头说没有什么，她告诉Wayne一定要阻止Frontia Project计划，他是他们唯一也是最后的希望了，说完就引爆了先前布置的炸弹，和NEVEC的部队一起永远地消失了。Wayne非常的窝囊，却又无可奈何只能不停地敲打着VS机舱出气。
Yuri眼前一片漆黑，突然听到了响动，慢慢睁开双眼才勉强看到Wayne关切的扶起自己询问情况Yuri轻轻一笑，说道我知道你有很多话要说，等事情结束后我们再谈吧，赶快去阻止Frontia Project计划，利用我给你的晶片，我就是为了这个才来到NEVEC内部的，如果因为我耽误了时间没有阻止，我死都不会瞑目的，我的朋友……这个时候Yuri还想说些什么，却垂下头将这句话永远的带走了。一旁的Luka终于忍受不住，开始哽咽了起来，Rick也开始无声的哭泣，这个时候Wayne的愤怒燃升到了极限，他愤恨地站起来，咬牙道我一定会杀了Isenberg，阻止Frontia Project，为你，我的父亲以及basil和所有死去的人报仇的，不顾一切的进入VS准备和Isenberg拼命。正当Wayne要出发的时候Luka来到VS前让Wayne务必小心，她说她听到你Wayne和Basil的对话让Wayne一定平安的回来，最后终于按捺不住，道出心声让Wayne为了自己一定要回来并且让他，并且向她保证，因为她再也不想失去任何人了，Wayne似乎想说什么终于没有说出口来，启动VS，出发了……
战斗结束后，由于Wayne使用晶片后，身体开始不堪重负，记忆也开始变得模糊起来。这个时候Joe的声音出现在无线电里，询问他的情况，而后Luka的声音代替了Joe，原来她在赶来的路上一直在呼叫Wayne，关心他的安危，Wayne说自己没有事。Joe突然切入进来说自己终于阻止了Frontia Project，Wayne称赞他做的好，但是说完后却已记不起Joe是何人，Luka见Wayne的记忆越来越模糊询问他是否还记得自己，Wayne答道当然记得。突然，VS的视野内Wayne发现Isenberg正在挣扎着爬出自己的VS，Wayne努力的集中仅余的神智，告诉自己只要再坚持下就好了，努力的走下VS，为了牺牲的所有人要亲手击杀Isenberg。这个时候Luka赶到了正在倒塌的基地旁，不顾掉下来的岩石，毅然顶着失去生命的危险，跑着寻找Wayne。Isenberg发现了出现在自己面前的Wayne自己陷入了暴怒的状态，自己的计划屡次被Wayne破坏，最后所有的心血都毁于一旦，开枪愤怒的向Wayne射击，Wayne中了两枪，第三枪把手上的晶片击飞，Wayne支撑着身体，在手臂发生变化前开出了结束一切的一枪，所有的恩怨在此了结……
Luka自述：一年以后，我终于从Yuri的离开中振作起来，那天起也再也没有见到过Wayne，但是为了了却Yuri的心愿我和Rick一直在努力。只见Luka驾驶着摩托在雪地上驰骋，来到目的地后，和Rick联系，Rick从基地放出了许多类似Thermal Energy的东西固定在周围的雪地上，并和Luka说看样子应该能正常工作，于是开始启动，这个时候无线电里Rick突然惊呼起来同时Luka眼前的仪器也开始发出怪异的绿光，闪光后，奇异的景象发生了，仪器周围的雪地开始融化，美丽的景色浮现在眼前，Luka和Rick欣喜若狂，互相庆祝，并且感叹如果Yuri和Wayne能看见这一幕该多好，虽然这只是小小的一步，但是却是一个新的开始。这个时候山顶上出现个诡异的男人（估计被外星人抓走刚放回来，看见美女准备下山劫色），对眼前的景象产生惊叹，Luka惊异的发现眼前的男子居然是Wayne，一时兴奋的不知道该说怎么才好，支吾着询问，但是Wayne却好象不认识她似的，Luka镇定了下自己上前介绍道自己：“My name is Luka.Nice to meet you."预示着故事和这个星球一样，一切从新开始……
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